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Gene essentiality for tumor growth influences neoantigen-directed immunoediting = 유전자의 암 생장 필수성이 신생항원 매개 면역 회피 현상에 미치는 영향 연구
서명 / 저자 Gene essentiality for tumor growth influences neoantigen-directed immunoediting = 유전자의 암 생장 필수성이 신생항원 매개 면역 회피 현상에 미치는 영향 연구 / Jae-Soon Park.
저자명 Park, Jae-Soon ; 박재순
발행사항 [대전 : 한국과학기술원, 2020].
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8035682

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MBIS 20008

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초록정보

Neoantigens arisen from mutated proteins in cancer cells are cancer-specific and can be highly immunogenic. However, outgrowth of tumor clones down-regulating their antigens can evade from immune responses. Here, I defined constitutive neoantigen and facultative neoantigen according to the essentiality of neoantigen-expressing genes for tumor growth based on functional screening and single-cell transcriptome data. Our own and public cohort data revealed the influence of the gene-level properties on clinical responses to immune checkpoint inhibitor. The pre-therapy constitutive neoantigen load and on-therapy down-regulation of the constitutive neoantigens contributed to positive clinical responses. In contrast, patients with negative clinical responses showed expansion of tumor clones down-regulating facultative neoantigens, implying immunoediting. Therefore, immunoediting may possibly be minimized by steering anti-tumor immune responses toward neoantigens expressed from essential genes.

암 세포의 돌연변이 단백질에서 유래한 신생항원은 암 특이적으로 발현되고 면역 반응을 효과적으로 일으킨다. 그러나, 신생항원의 발현을 저하시킨 암 세포들이 증식하면 면역반응으로부터 회피할 수 있다. 본인은 유전자 기능 검사 데이터와 단일세포 전사체 데이터를 바탕으로 계산한 신생항원 유래 유전자의 암 생장 필수성을 근거로 지속 발현 신생항원과 선택 발현 신생항원을 정의하였다. 본 연구에서는 면역관문억제제를 투여받은 환자군을 통해 신생항원 유래 유전자의 기능이 면역관문억제제에 대한 치료 예후에 영향을 끼칠 수 있다는 사실을 밝혀내었다. 치료 전 지속 발현 신생항원과 치료 중 지속발현 신생항원의 발현 저하는 긍정적인 치료 예후에 기여한다. 반면에, 부정적인 예후를 보인 환자군에서는 선택 발현 신생항원의 발현이 저하된 암 세포들이 증식하는 현상을 확인하였으며, 이는 면역 편집 현상을 암시한다. 따라서, 항암 면역 반응을 암 생장에 필수적인 유전자로부터 발현된 신생항원을 향하도록 유도한다면 면역 편집 현상을 최소화 할 수 있는 가능성이 열린다.

서지기타정보

서지기타정보
청구기호 {MBIS 20008
형태사항 iii, 52 p. : 삽도 ; 30 cm
언어 영어
일반주기 저자명의 한글표기 : 박재순
지도교수의 영문표기 : Jung Kyoon Choi
지도교수의 한글표기 : 최정균
학위논문 학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 바이오및뇌공학과,
서지주기 References : p. 47-50
주제 neoantigen
gene essentiality
immune checkpoint inhibitor
immunoediting
tumor
신생항원
유전자 필수성
면역관문억제제
면역 회피
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