Although nucleosome is known to disturb the elongation of RNA polymerase II (RNAPII), the detailed mechanism to facilitate nucleosome disassembly during RNAPII elongation is not well understood in vivo. This study identifies $Fun30^{Fft3}$ as the chromatin remodeler which promotes RNAPII elongation by facilitating nucleosome disassembly in fission yeast. $Fun30^{Fft3}$ is required to maintain RNAPII occupancy in transcription elongation-related histone chaperone FACT-dependent manner. And $Fun30^{Fft3}$ is recruited at transcribed regions in transcription-dependent manner and associates with RNAPII and RNAPII elongation-related factors. Surprisingly, simple mathematical approach suggests that $Fun30^{Fft3}$ facilitates transcription-coupled nucleosome disassembly which is correlated with RNAPII regulation function of $Fun30^{Fft3}$. Furthermore, nucleosome-barrier relieving mutations defective to histone deacetylase complex Clr6 complex II and histone level suppress the both growth and RNAPII occupancy defects of cells lacking $Fun30^{Fft3}$. These results suggest that RNAPII uses the chromatin remodeler $Fun30^{Fft3}$ to facilitate nucleosome disassembly during transcription elongation in vivo.
뉴클레오좀이 RNA 중합효소 II (RNAPII)의 신장을 방해한다는 사실은 알려졌으나, 생체 내에서 전사 신장 과정 동안 뉴클레오좀을 해체하는 자세한 기전은 명확히 이해되고 있지 않다. 본 연구는 분열효모에서 $Fun30^{Fft3}$ 가 뉴클레오좀 해체를 통해 RNAPII 신장을 촉진한다는 사실을 밝혀냈다. $Fun30^{Fft3}$ 는 전사 신장과 관련된 히스톤 샤페론 FACT와 더불어 RNAPII 신장을 촉진한다. 그리고 $Fun30^{Fft3}$ 는 단백질 암호화 부위에서 전사의 강도에 따라 도입되고, RNAPII 신장과 관련된 단백질들과 상호작용한다. 놀랍게도, 수학적 모델을 통해 $Fun30^{Fft3}$ 가 전사와 연계되어, $Fun30^{Fft3}$ 의 RNAPII 조절과 상관관계를 보이며, 뉴클레오좀 해체를 촉진한다는 것을 제안하였다. 더 나아가, 히스톤 탈아세틸화효소 복합체 (Clr6 복합체 II)와 히스톤 유전자 돌연변이체들이 $Fun30^{Fft3}$ 결실 돌연변이체에 의해 야기되는 세포 성장 저해와 염색질 상의 RNAPII 점유도 감소 문제를 모두 완화했다. 이러한 결과들은 세포 내에서 RNAPII가 전사 신장 과정 동안 염색질 개조 효소 $Fun30^{Fft3}$ 를 이용하여 뉴클레오좀 해체를 촉진한다는 모델을 제시한다.
