Melanoma is one of the most aggressive types of skin cancer with significant heterogeneity in overall survival. Currently, tumor-node-metastasis (TNM) staging is insufficient to provide accurate survival prediction and appropriate treatment decision-making for several types of tumors, such as melanoma patients. Therefore, identifying more reliable prognosis biomarkers is urgently essential. Recent studies have shown melanoma patients with low immune infiltration have shorter survival. Here I construct a prognostic-related gene signature for melanoma risk stratification by quantifying the levels of several cancer hallmarks and identified the Wnt/β-catenin
activation pathway as a primary risk factor for low tumor immunity and, consequently, shorter survival. A series of bioinformatics and statistical methods combined and applied to construct a Wnt-immune-related gene signature. With this gene signature, I computed risk scores for individual patients that can predict overall survival. To evaluate the robustness of the result, I validated the signature in multiple independent GEO datasets. Finally, an overall survival-related nomogram was established based on the gene signature and clinicopathological features. The Wnt-immune-related prognostic risk score could more significantly predict the overall survival compared with standard clinicopathological features. These results provide a comprehensive map of the oncogene-immune-related gene signature that can serve as valuable biomarkers for better clinical decision-making
흑색종은 전체 생존에서 상당한 이질성을 갖는 가장 공격적인 유형의 피부암 중 하나이다. 현재 tumor-node-metastasis (TNM) staging는 흑색종 환자와 같은 여러 유형의 종양에 대한 정확한 생존 예측 및 적절한 치료 결정을 제공하기에는 불충분하다. 따라서 보다 신뢰할 수 있는 예후 바이오 마커를 식별하는 것이 시급하다. 최근 연구에 따르면 면역 침윤이 낮은 흑색종 환자는 생존 기간이 더 짧다. 여기에서 우리는 여러 암 특징의 수준을 정량화하여 흑색종 위험 계층화에 대한 예후 관련 유전자 서명을 구성하고 Wnt/β-catenin 활성화 경로를 낮은 종양 면역 및 결과적으로 더 짧은 생존에 대한 주요 위험 인자로 식별했다. 일련의 생물정보학 및 통계적 방법을 결합하고 적용하여 Wnt-면역 관련 유전자 서명을 구성했다. 이 유전적 특징은 전체 생존을 예측할 수 있는 개별 환자의 위험 점수를 계산하는 데사용되었다. 결과의 견고성을 평가하기 위해 여러 개의 독립적인 GEO 데이터 세트에서 서명을 검증했다. 마지막으로 유전적 특징과 임상병리학적 특징을 기반으로 전체 생존 관련 노모그램(nomogram)을 확립했다. Wnt 면역 관련 예후 위험 점수는 표준 임상병리학적 특징과 비교하여 전체 생존을 더 유의하게 예측할 수 있다. 이 연구의 결과는 더 나은 임상 의사 결정을 위한 귀중한 바이오 마커 역할을 할 수 있는 종양 유전자 면역 관련 유전자 서명의 포괄적인 지도를제공한다.
