서지주요정보
Mitochondria associated markers in obese phenotype inferred from adipose tissue gene expression data = 지방 조직 전사체 데이터 기반 미토콘드리아 연관 세포 표현형 마커 발굴
서명 / 저자 Mitochondria associated markers in obese phenotype inferred from adipose tissue gene expression data = 지방 조직 전사체 데이터 기반 미토콘드리아 연관 세포 표현형 마커 발굴 / Nina Kunsic.
저자명 Kunsic, Nina ; Kunsic Nina Kunsic, Nina
발행사항 [대전 : 한국과학기술원, 2017].
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8031329

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MBIS 17022

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초록정보

Mitochondrial dysfunction was implicated in a diverse set of diseases such as cancer, neurodegenerative disease, cardiovascular disease and metabolic disease. Prior research showed that mitochondria may play a role in onset of obesity or obesity related metabolic complications. I have used three different analysis methods - differential gene expression analysis, differential gene gene correlation and co-expression network based analysis, in order to elucidate possible mechanism connecting mitochondrial function and obesity and to identify mitochondria related obesity markers. This resulted in a set of potential disease markers, which were further tested for their ability to differentiate between obese and non-obese samples by training a random forest classifier and testing it on an independent testing data set. The result of this analysis is a list of 25 mitochondria associated genes showing high importance in obese sample classification, along with a list of 80 genes identified as significant by more than one type of analysis and may therefore represent potential mitochondria associated obesity markers.

미토콘드리아 기능 장애는 암, 신경 퇴행성 질환, 심혈관 질환 및 대사성 질환과 같은 다양한 질병에 관련되어 있습니다. 이전의 연구에 따르면 미토콘드리아는 비만이나 비만과 관련된 대사성 합병증의 발병에 역할을 할 수 있습니다. 미토콘드리아 기능과 비만을 연결하는 메커니즘을 밝히고 미토콘드리아 관련 비만 마커를 확인하기 위해 세 가지 분석 방법, 차동 유전자 발현 분석, 미분 유전자 유전자 상관 관계 분석 및 동시 발현 네트워크 기반 분석을 사용했습니다. 이로 인해 일련의 잠재적 인 질병 마커가 만들어졌으며, 무작위적인 포레스트 분류기를 학습하고 독립적 인 테스트 데이터 세트에서 테스트함으로써 비만 및 비만 샘플을 구별하는 능력에 대해 추가로 테스트하였습니다. 이 분석의 결과는 비만 표본 분류에서 매우 중요한 미토콘드리아 관련 유전자 목록과 두 가지 이상의 유형 분석에서 중요한 것으로 확인 된 80 가지 유전자의 목록과 잠재적 인 미토콘드리아 관련 비만 지표를 나타낼 수 있습니다.

서지기타정보

서지기타정보
청구기호 {MBIS 17022
형태사항 iv, 31 p. : 삽도 ; 30 cm
언어 영어
일반주기 저자명의 한글표기 : Nina Kunsic Nina Kunsic
지도교수의 영문표기 : Gwan Su Yi
지도교수의 한글표기 : 이관수
학위논문 학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 바이오및뇌공학과,
서지주기 References: p. 28-31
주제 Differential gene expression analysis
differential gene-gene correlation
network analysis
classification
obesity
mitochondrial dysfunction
차별 유전자 발현 분석
차별 유전자 - 유전자 상관 분석
네트워크 분석
분류
비만
미토콘드리아 기능 장애
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