Solution structures of several single-strands oligodeoxyribonucleotides were investigated by NMR experiments.
Oxytricha telomeric oligonucleotide, $d(G_4T_4G_4)$, showed various solution structure depending on ionic strength and countercation and how the samples were prepared. The reverse-Hoogsteen base-paired simple-foldback structure formed in vitro says that it may be possible model of telomere in vivo.
An alternative homo-purine oligonucleotides, $d(AG)_3$ gives a monomeric self-complex stabilized by ionic bonds at low pH in a low ionic solution.
As the ionic strength is increased, the oligonucleotides, $d(AG)_3$, showed another form of self-complex at low temperature. Preliminary NOESY experiment showed the possibility of existence of adenine-tetrad.
핵자기 공명 분광분석 실험으로 외가닥 DNA들에 대한 액상 구조를 연구하였다. Oxytricha telomeric DNA, $d(G_4T_4G_4)$는 염의 종류와 농도, 시료의 준비과정에 따라서 액상에서 다양한 구조로 관찰되었다. 시험관에서 관찰되는 reverse-Hoogsteen 염기쌍에 의해 유도되는 단순되꺾임 구조는 생체내에서 telomere가 가질것으로 예상되는 구조로 보인다. 교대로 반복되는 purine DNA인 $d(AG)_3$는 이온세기가 낮고, 수소이온 농도가 낮은 용액에서는 이온결합에 의해 안정화되는 단분자자가복합체의 구조를 가진다. 이온세기가 증가하고, 수소이온농도가 중성일 때는 $d(AG)_3$는 낮은 온도에서 염기쌍을 갖는 또다른 자가복합체를 형성한다. 이에대한 예비적인 NOESY 실험은 adenine-tetrad의 존재를 암시해주었다.
