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Transcriptional analysis on apoptosis and autophagy of CHO cells subjected to hyperosmotic stress = 고삼투 환경에서의 CHO 세포의 Apoptosis 와 Autophagy 발현 분석
서명 / 저자 Transcriptional analysis on apoptosis and autophagy of CHO cells subjected to hyperosmotic stress = 고삼투 환경에서의 CHO 세포의 Apoptosis 와 Autophagy 발현 분석 / YeonJung Kim.
저자명 Kim, YeonJung ; 김연정
발행사항 [대전 : 한국과학기술원, 2015].
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초록정보

CHO cells are subjected to cell death under the stress induced conditions such as hyperosmolality, encompassing increasing of therapeutic protein production. With antibody-producing recombinant CHO cells (rCHO), we induced hyperosmotic stress condition up to 510 mOsm/kg. To examine apoptosis and autophagy as representative cell death together, it is important to analyze the genes related to apoptosis and autophagy simultaneously. So, we select CHO microarray technology to analyze apoptosis and autophagy. In used CHO microarray, there are 75 genes which are related to apoptosis and autophagy. Under hyperosmotic stress cultivation, we considered upregulated genes as 1.5-fold increase of expression level and downregulated genes as 0.5-fold decrease of expression level. Among total apoptosis and autophagy-related 75 genes, 51 genes showed upregulated expression and 24 genes showed downregulated expression. The functional analysis of genes was carried out by classification of signaling pathways. For group of apoptosis signaling pathways, generally the number of upregulated apoptosis-related genes were more prevalent than downregulated genes. However, in p53 signaling pathway, the number of downregulated apoptosis-related genes were prevalent than upregulated genes. For group of autophagy signaling pathways, generally the number of upregulated autophagy-related genes were more prevalent than downregulated genes. However, in p53 signaling pathway and unidentified group, the number iof downregulated autophagy-related genes were prevalent than upregulated genes. The functional signaling pathways which were common to both apoptosis and autophagy were also examined detail. So, we conclude that this research could provide potential possibility to investigate the crosstalk between apoptosis and autophagy.

Chinese hamster ovary (CHO) 세포를 고삼투 환경에서 배양할 경우 치료용 단백질의 생산성은 증가하지만 스트레스를 받아 세포사가 일어나게 된다. 항체를 생산하는 CHO 세포주를 control (310 mOsm/kg)과 osmotic stress (510 mOsm/kg) 환경에서 배양하여, 세포사로 대표적인 Apoptosis와 Autophagy의 경로를 자세히 관찰하고자 하였다. 분석 방법으로는 Apoptosis, Autophagy와 연관된 유전자의 발현을 동시에 분석할 수 있는 CHO microarray를 사용하였다. 사용된 CHO microarray에는 세포사로 대표적인 Apoptosis, Autophagy와 연관된 75개의 유전자가 존재한다. 75개의 유전자들을 대상으로 control 대비 고삼투 환경에서 1.5배 유전자 발현이 증가 혹은 0.5배 유전자 발현이 감소한 것들을 대상으로 분석하였다. Apoptosis, Autophagy 와 연관된 전체 75개 유전자들 중, 51개의 유전자의 발현이 증가하였으며 24개의 유전자의 발현이 감소하였다. Apoptosis, Autophagy와 연관된 유전자들의 기능을 검색하여 signaling pathway로 분류하였다. Apoptosis signaling pathway에 분류된 기능을 살펴보았을 때, 전반적으로 유전자 발현이 증가가 감소보다 많았으며, 반면에 p53 signaling pathway에서는 유전자의 발현이 감소된 것이 많았다. Autophagic signaling pathway에 분류된 기능을 살펴보았을 때, 전반적으로 유전자 발현이 증가가 감소보다 많았으며, 반면에 p53 signaling pathway와 unidentified된 그룹에서는 유전자의 발현이 감소된 것이 많은 것으로 관찰되었다. 이들 중 Apoptosis, Autophagy 모두와 연관된 기능을 하는 signaling pathway 에 포함된 유전자 발현의 증가와 감소도 함께 살펴보았다. 본 연구를 바탕으로 하여 Apoptosis, Autophagy 각각의 역할을 하는 유전자 발현의 증가와 감소에 따른 상호작용을 확인해볼 수 있는 가능성을 보았다.

서지기타정보

서지기타정보
청구기호 {MBS 15002
형태사항 vi,121 p. : 삽도 ; 30 cm
언어 영어
일반주기 저자명의 한글표기 : 김연정
지도교수의 영문표기 : Gyun Min Lee
지도교수의 한글표기 : 이균민
수록잡지명 : "Autophagy and its implication in Chinese Hamster Ovary Cell Culture ". Biotechnology Letters, v.35.issue.11, 1753-1763(2013)
Including Appendix
학위논문 학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 생명과학과,
서지주기 References : p.
주제 CHO
gene
apoptosis
autophagy
hyperosmotic stress
중국햄스터난소세포
유전자
에이팝토시스
오토파지
삼투압
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