DNA is known to have a dimeric structure (double helix), triple body (triple helix), G-quadruplex con-dition of depending on the type of cations, for example Mg2+, Na+, K+ . In addition, G-quadruplex has re-ceived a lot of interest in the development of anti-cancer drugs. This structure interacts with the drug, and prevents a process that occurs selectively in cancer cells.
In this study, we attached a fluorescent substance to the DNA and dissolved these subtance in such ions. And we observed the FRET phenomenon by using emission spectrum of the fluorescent substance . Thereby we can confirm the existence and generation condition of quadruplex. Also, we observed G-quadruplex DNA in certain cation solution by using CD(Circular Dichroism) spectrum experiments. Using our experiment results, we aims to get a more in-depth understanding of G-quadruplex DNA.
DNA 는 Mg2+,Na+,K+ 이온의 종류에 따라 이중체(double helix) , 삼중체(triple helix), G-사중체(quadruplex) 의 구조를 가진다고 알려져 있다. 특히 G-quadruplex는 항암제 개발에서 많은 관심을 받고 있다. 그 이유는 이 구조가 약물과 상호작용하여 텔로미어 확장(telomere extension) , 즉 암 세포에서 선택적으로 발생하는 공정을 저지하기 때문이다.
이번 연구에서는 이런 다양한 이온에 녹아있는 DNA에 형광물질을 붙여 그 형광물질의 emission Spectrum 을 통해 FRET 현상 을 관찰하고, 이를 통해 Quadruplex 의 생성 조건 및 존재 확인. 그리고 이를 통해 G-quadruplex DNA의 상호작용에 대해 이해하는 것을 목적으로 한다.