To make model and analyze biological signaling network is a major challenge of Systems Biology. Here we suggest Switching Boolean Network using Threshold Boolean Network and we made Acute myeloid leukemia (AML) signaling network and analyzed this network to find component which make signaling network abnormal by being deregulated.
Acute myeloid leukemia (AML) features the rapid growth of abnormal white blood cells that accumulate in the bone marrow and perturb the production of normal blood cells. We constructed AML singling network by combining the signaling pathways involved in myeloid differentiation or cell proliferation. We analyzed this singling network using Switching Boolean network.
The result of this analysis showed similar result with previous studies. Some of the components which we found in this simulation were experimentally validated by other research. Some of them were new foundation.
생물학적인 신호전단네트워크를 모델링하고 분석하는 것은 시스템생물학의 주요 과제중의 하나이다. 이 연구에서 나는 임계 치 부울 네트워크의 문제점인 미완성인 네트워크에 의해 발생하는 실제 생물학적 지식과의 차이점과 신호전달속도가 다른 점을 표현하지 못한다는 단점을 보안한 스위칭 부울 네트워크를 제안하였다. 스위칭 부울 네트워크는 각 노드의 임계 치를 다르게 함으로써 임계치 부울 네트워크의 단점을 보안하였고 신호전달속도가 다른 점을 표현하기 위하여 비동기적 업데이트 방법을 사용하여 노드의 상태를 업데이트 하였다.
혈액세포의 분화와 증식에 문제가 발생하여 발생하는 Acute Myeloid Leukemia(AML)의 네트워크를 구성한 후 스위칭 부울 네트워크를 사용하여 모델링하고 분석하였다. 단일 노드의 문제로 인해 분화와 증식에 이상을 가져오는 노드들의 리스트를 만들었다. 이렇게 만들어진 리스트 중에서 약 70%의 노드들 즉 단백질들은 이미 AML의 약 개발 대상으로 연구가 진행이 되고 있음을 문헌을 통하여 확인 할 수 있었다. 나머지의 노드들은 AML 약 개발의 후보로서 제안 하였다.
