Ge (001) surface was modeled as a molecular cluster. The several conditions of the cluster model were varied by the Grid application, generating the multiple choices of the model. These models were benchmarked on the Grid system. After that, the potential energy surface of acetylene movement over the model Ge (001) surface was scanned, in order to study the adsorption reaction. The each point of the potential energy surface was calculated on the distributed node of the Grid system. These results show that the concept of high throughput computing can be successfully adopted to computational chemistry with Grid. The Grid system for the presented work and its simple architecture were developed.
Ge (001) 표면을 분자 클러스터로 모사하였다. 분자 클러스터 모델의 계산 조건들을 그리드 애플리케이션 수준에서 다양하게 바꾸어 보면서, 다양한 형태의 모델들을 제시하였다. 그리고 그리드상에서 이러한 모델들의 적합성을 평가해 보았다. 다음으로, 흡착 반응에 대한 정보를 얻기 위하여, Ge (001) 표면 위에 배치된 아세틸렌 분자의 움직임에 따른 포텐셜 에너지 표면을 구해 보았다. 그리드의 분산된 컴퓨터 자원을 효율적으로 활용하기 위해, 포텐셜 에너지 표면 상의 각각의 점들을 동시에 분산 처리하여 계산하였다. 이상의 결과들은 High Thorughput Computing (HTC)의 개념이 그리드를 활용하여 성공적으로 전산 화학 분야에 적용될 수 있음을 보여준다. 본 연구를 위하여, 웹 애플리캐이션 개념과 Globus에 바탕을 두고 자체적인 그리드 아키텍처를 고안했으며, 이를 바탕으로 실제 그리드 시스템을 구축하여 사용하였다.
