Transcription from the P- l promoter of the E. coli rnpB gene encoding a stable RNA, MI RNA, is repressed upon the stringent response. The GC-rich discriminator region (positions -7 to -1) between the -10 region and the transcription start site is known to be responsible for this transcription repression. Since transcription from the rnpB promoter starts at the G nucleotide, the +1 start site may be involved in generating stringent signals. In this study, we generated various promoter variants, from which transcription started with G or A, by introducing mutations at positions -1 and/or +1. The transcription site was shifted to one nucleotide upstream when the C nucleotide at position -1 was changed to G or A. Therefore, we were able to obtain another set of the promoter variants carrying the 6-bp discriminator region, in addition to a set of the promoter variants having the normal 7-bp discriminator region. The stringent response of these promoter variants was examined. The results indicate that the GC pair at the transcription start site is also involved in generating stringent signals like the GC pairs in the discriminator region. The stability of initiation complexes of the promoter variants was also examined. Promoter variants having A at the +1 site, which should less stringent repression, form more stable initiation complexes than promoter variants having G at the +1 site.
대장균의 촉진 유전자의 -10 영역과 전사 개시점 사이의 영역은 GC 의 염기가 집중된 곳으로서, 긴축 조절 되어지는 촉진 유전자들의 전사 조절에 관여하는 구별 유전자 영역으로 알려져 있다. 대장균의 rnpB 촉진 유전자 또한 긴축 조절을 받으며, 위 영역 중에서도 특히 -1 위치가 긴축 조절에 중요한 곳으로 알려져 왔다. 또한 이 촉진 유전자는 전사 시작점이 G 염기 이므로 시작점 또한 긴축 조절에 관여하여 전사에 영향을 미칠 것이라는 예상으로, 전사 시작점과 -1 위치가 다른 염기로 치환된 돌연변이 촉진 유전자를 이용하여, 그 전사 개시 복합체의 안정성과 생성된 RNA의 안정성을 측정하고, 각각의 돌연변이가 긴축 조절에 미치는 영향을 측정하였다.
그 결과, 전사 시작점이 A 염기인 돌연변이 촉진 유전자는 전사 시작점이 G 염기인 돌연변이 촉진 유전자 보다 긴축 조절의 영향을 덜 받았으며, 그 전사 개시 복합체가 더 안정하였다. 이로서, rnpB 촉진 유전자의 전사 개시점은 긴축조절에 관여하는 구별 유전자 영역에 포함되며, 전사 시작에 미치는 긴축 조절의 영향에 대해서 관계할 수 있는 가능성을 제안 할 수 있다.
