A search for a gene responsible for a low-affinity transporter of D-ribose revealed that the Escherichia coli K-12 strain MC4100 utilizes D-allose as a sole carbon source by having D-allose transporter. The operon involved in D-allose metabolism was localized at 92.8 min of the E. coli linkage map. It consists of six genes which are inducible by D-allose and are under the control of the repressor gene alsR. This operon is also subject to catabolite repression. Three genes, alsB, alsA, and alsC, appear to be necessary for transport of D-allose as well as for transport of structurally related D-ribose at low affinity. D-allose-binding protein encoded by alsB is a periplasmic protein, which has an affinity to D-allose with a Kd of 0.33 micro M. The transport system has a feature of binding protein-mediated ABC-transporter which includes an ATP-binding component (AlsA). It was found that AlsE (a putative D-allulose-6-phosphate 3-epimerase), neither AlsK (a putative D-allose kinase) nor RpiB (a putative D-allose-6-phosphate isomerase), is necessary for allose metabolism. During this study, the strain W3110, a well-known wild type E. coli, was found to have a defect in the transport of D-allose mediated by the allose permease.
It was observed that Escherichia coli can still grow on D-ribose in the absence of both the ribose and the allose permease. Futhermore, since several partially characterized mutations also affects the ribose growth (Rha-, xylA-, a locus linked to rbs operon), it seems that low-affinity D-ribose transport is mediated by a sugar specific system such as in the cases of D-xylose and L-arabinose which have their specific low-affinity transport systems.
대장균의 저친화성 리보스 수송계에 대한 연구의 결과로서 MC4100 균주가 특이적인 수송계를 통하여 D-알로스를 탄소원으로 이용할 수 있다는 사실을 알게 되었다. 알로스 대사에 관련된 오페론은 대장균 유전자 지도의 92.8분에 위치 하며, 7 개의 유전자로 구성되어 있고 alsR이라 명명된 Repressor 유전자에 의해서 발현이 조절되며, 일반적인 여타의 당이용 오페론들과 마찬가지로 Catabolite Repression을 받는다. 이 오페론의 alsB, alsA 및 alsC의 세 유전자는 D-알로스 수송 및 이와 구조적으로 유사한 D-리보스의 저친화성 수송에 반드시 필요하다. alsB 유전자에 의해서 발현되는 Periplasmic 결합단백질은 D-알로스에 대한 친화성이 Kd 값으로 나타내어 0.33 micro-M을 갖는다. 이 수송계는 ATP-결합소자 (AlsA)를 포함하며, 결합단백질에 의해서 매개되는 전형적인 ABC-수송계이다. D-알로스 대사에 과정에 꼭 필요한 세가지의 활성을 나타낼 것으로 보이는 유전자들 중, D-allulose-6-phosphate 3-epimerase의 기능을 갖는 것으로 추정되는 AlsE는 반드시 필요한 것으로밝혀 졌으나, AlsK (잠정적 알로스 인산화효소)와 RpiB(잠정적 D-allose-6-phosphate isomerase)는 반드시 필요한 것은 아닌 것으로 보인다. 이 연구의 진행도중, 잘 알려진 대장균의 야생형의 하나인 W3110이 알로스수송계에의한 알로스수송에 결함이 있다는 것이 밝혀졌다.
한편, 대장균은 리보스 및 알로스 수송계가 모두 없는 상태에서도 여전히 리보스를 이용하여 성장을 하며, 몇가지 부분적으로 규명된 돌연변이들도(Rha-, xylA-, rbs operon부근의 어딘가) 이에 영향을 미치는 것으로 보임에 따라, D-xylose나 L-arabinose에서와 같은 기질의 특 이성을 갖는 고유의 저친화성 수송계가 리보스에는 없는 것으로 추정된다.