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Polyphasic taxonomy of microbacterium soli US15, a novel xylan-degrading bacterium isolated from the soil in Ulsan, Korea = 색소 기질법을 이용하여 울산 토양에서 분리한 새로운 자일란 분해균, Microbacterium soli US15 의 분류학적 연구
서명 / 저자 Polyphasic taxonomy of microbacterium soli US15, a novel xylan-degrading bacterium isolated from the soil in Ulsan, Korea = 색소 기질법을 이용하여 울산 토양에서 분리한 새로운 자일란 분해균, Microbacterium soli US15 의 분류학적 연구 / Hye-Yoon Park.
발행사항 [대전 : 한국과학기술원, 2005].
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A novel xylan-degrading bacterium $US15^T$ was isolated from soil near Ulsan metallic treatement plant. The strain was Gram-positive, non-motile, non-spore-forming and coccoid-shaped rod. It formed yellow colonies on nutrient agar and showed chemotaxonomic markers that were consistent with classification in the genus Microbacterium, i.e. MK-12, MK-11 and MK-13 as major menaquinones; predominating iso- and anteiso-branched cellular fatty acids; glucose, galactose, fucose and mannose as cell-wall sugars; peptidoglycan-type B2β with glycolyl residues; G+C content of 66.5 %. Phylogenetic analysis, based on 16S rRNA gene sequencing, showed strain $US15^T$ was most similar to M. imperiale (96.9%), M. arborescens (96.8%) and M. ulmi (96.2%). It is clear from phylogenetic analyses based on complete 16S rRNA sequences data that the isolate is a member of genus Microbacterium and represents a differentiated phyletic line that can be equated to a separate genomic species. On the basis of these genotypic and phenotypic results, it is proposed that $US15^T ( = DSM 16915^T = KCTC 19080^T)$ be classified as the type strain of a novel Microbacterium species, for which the names Microbacterium soli sp. nov. is proposed.

울산의 토양에서 새로운 자일란 분해 균인 US15을 색소 기질법을 사용하여 분리하였다. 이 균주는 그람양성균에 해당되며, nutrient agar 배지에서 노란색, 점성이 있는 구상의 콜로니를 형성한다. 또한 이 균주는 광학 현미경 상에서 구상으로 관찰되며, 편모가 없고 이동성이 없다. 화학분류적 특성으로 펩티드글리칸의 유형으로는 B2β, 세포벽을 구성하는 물질로서 아미노산은 L-lysine, 당 성분으로는 rhamnose, glucose, galactose, fucose그리고 mannose가 검출되었다. 또 다른 화학분류적 특성으로 $anteiso-C_{15:0}$, $anteiso-C_{17:0}$ 그리고 $iso-C_{16:0}$ 가 주된 지방산 성분으로 밝혀졌으며, 주 메나퀴논으로는 MK-11과 MK-12가 검출되었다. 이러한 결과는 이 균주가Microbacterium속의 전형적인 화학분류학적 성질을 나타내고 있음을 입증한다. 균주 US15의 16S rDNA 염기서열은 Microbacterium imperiale IFO $12610^T$ , Microbacterium arborescens IFO $3759^T$ 그리고Microbacterium ulmi LMG $20991^T$ 대표 균주들의 염기서열과 각각 96.9, 96.8, 96.2 %의 상동성을 보였다. 이와 같은 수치는 속 내에서 다른 종으로 분리할 수 있는 범위 내에서 속하며, 계통 수 상에서 균주 US15는 다른 종들과 분리된 새로운 가지 상에 위치한다. 이러한 계통적 위치는 이미 알려진 모든 Microbacterium 속내의 종들과 탄소기질 이용, 효소활성 및 산 생성과 같은 생화학적 실험 결과 차이에 의해 더욱 뒷받침된다. 유전자형과 표현형에서 나타나는 종합적 결과는 US15가 Microbacterium 속 내에 새로운 종이라는 것을 나타내고 있으며, 새로운 종으로 Microbacterium soli를 제안한다.

서지기타정보

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청구기호 {MBS 05025
형태사항 v, 40 p. : 삽화 ; 26 cm
언어 영어
일반주기 저자명의 한글표기 : 박혜윤
지도교수의 영문표기 : Sung-Taik Lee
지도교수의 한글표기 : 이성택
학위논문 학위논문(석사) - 한국과학기술원 : 생명과학과,
서지주기 Reference : p. 35-37
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