Gram-negative, rod-shaped, non-spore-forming, yellow-pigmented bacteria isolated from a freshwater stream in Korea were investigated to determine their taxonomic status. Complete 16S rRNA gene sequence analysis indicated that the organisms should be placed in the Chryseobacterium-Bergeyella-Riemerella branch in the family, Flavobacteriaceae. Phylogenetically, the strains were most closely related to Chryseobacterium scophthalmum LMG $13028^T$ and Chryseobacterium joostei $lx 5a^T (=LMG 18212^T)$ (93.9% and 92.7% 16S rRNA gene sequence similarity, respectively) and they clustered their own peculiar branch. The strains contained menaquinone MK-6 as the predominant menaquinone and higher G+C mol% (41.7%) than other type strains in the Chryseobacterium-Bergeyella-Riemerella branch and contained $i-C_{15:0}$ as major fatty acid $i-C_{13:0}$, $anteiso-C_{15:0}$ as their own discriminative specific fatty acids. The phylogenetic distances from any validly described type strains and their phenotypic properties confirmed that the strains constitute a separate genus for which the name Kaistella koreensis gen. nov., sp. nov. $(type strain Chj707^T = KCTC 12107^T = IAM 15050^T)$ is proposed.
최근에, 분자생물학적인 기술이 발달함에 따라서 지금까지 발견되지 못했던 새로운 미생물이 분리되고 새로운 이름으로 명명, 분류되는 작업이 활발히 진행 중이다. 새롭게 발견된 세가지 strain $Chj707^T$, Ko2, Ko10의 경우도, 연구 결과 새로운 속(genus)에 해당하는 균주들임이 밝혀졌다. 새로운 속의 type strain이 된 균주 $Chj707^T$ 은 청주 공단 지역의 하천에서 분리되었으며, Ko2, Ko10 나머지 두 strain은 맥주 발효 폐수를 처리하는 혐기성 반응기의 슬러지로부터 분리되었다. 세가지 균주 모두 Gram-negative이고, 형태는 rod이며 spore를 형성하지 않았으며 노란색의 색소를 가지고 있었다. 세 균주의 16S rRNA gene의 염기서열을 분석한 결과, 모두가 하나의 종(species)에 속하며, 분류학적으로는 Flavobacteriaceae 과(family)의 Chryseobacterium-Bergeyella-Riemerella branch에 속하는 것으로 밝혀졌다. 가장 가까운 근연관계를 갖는 species들의 type strain들은 Chryseobacterium scophthalmum LMG $13028^T$ 이었고, 다음으로 가까운 균주는 Chryseobacterium joostei lx $5a^T(=LMG 18212^T)$이었다. (16S rRNA gene의 염기서열 유사도는 각각 93.9% and 92.7% 이었다.) 이 세 균주는 phylogenetic tree 상에서도 하나의 독특한 cluster를 형성하였다. 분류학적 위치를 결정하기 위한 화학분류(chemotaxonomy) 결과, 세 균주 모두 동일한 menaquinone, MK-6를 유일한 quinone으로 가지고 있었으며 ubiquinone은 검출되지 않았다. 이것은 이들이 Flavobacteriaceae 과(family)의 Chryseobacterium-Bergeyella-Riemerella branch에 속하는 것을 확인해 준 결과였다. G+C mol% 분석 결과 41.7%의 결과를 얻었으며, 이것은 Chryseobacterium-Bergeyella-Riemerella branch에 속하는 다른 species보다 다소 높은 G+C mol%를 가지고 있어서, 세 종류의 strain $Chj707^T$, Ko2, Ko10이 기존에 정립된 분류체계의 속(genus)에 속하지 않으며 새로운 속(genus)으로 명명해야 한다는 주장을 뒷받침해 주었다. 지방산 분석 결과, strain $Chj707^T$, Ko2, Ko10은 모두 $i-C_{15:0}$ 을 주된 지방산 (약 50%)으로 가지고 있었고, 그들만의 독특한 지방산으로 $i-C_{13:0}$, $anteiso-C_{15:0}$ 를 약 10% 씩 가지고 있어서 역시 새로운 속의 특징을 보여 주었다.
이와 같은 연구 결과를 토대로, Kaistella koreensis gen. nov., sp. nov. 라는 새로운 속(genus)을 제안하였고, 그 이름은 연구가 진행된 기관인 KAIST의 이름을 딴 속명(Kaistella)과 미생물들이 발견된 국가인 Korea의 이름을 딴 종명(koreensis)을 합쳐서 지어졌다. 새로운 속(genus)의 type strain으로 $Chj707^T (= KCTC 12107^T = IAM 15050^T)$ 이 선택되었다.
