Poly (ADP-ribose) polymerase [PARP; $NAD^+$ ADP-ribosyltransferase; EC 2.4.2.30] is activated by DNA strand breaks. Because DNA breaks are produced by many genotoxic agents, the function of chromatin associated PARP has been implicated to participate in the process of DNA repair. Electrophoretic mobility shift assay was carried out to define the binding properties of PARP to the damaged DNA. Oligonucleotide as short as 10mer was a good substrate to make a shift-up band. Competitive inhibition experiment with single-strand or supercoiled DNA suggested a positive correlation between binding capacity of PARP with DNA and catalytic activity to polymerase ADP-ribose unit. The substrate DNA containing photoadduct showed markedly decreased affinity while a single base pair lesion with $O_6$-Me-dG did not cause any significant decrease in the binding affinity. These results indicate that maintenance of B-form helix conformation at the region of binding site is required for proper function of PARP. Data also suggest that PARP may participate in DNA polymerization and ligation step during celluar repair process
Poly (ADP-ribose) polymerase와 DNA 수선과정과의 연관성을 이해하기 위한 시도로서, DNA 손상이 poly (ADP-ribose) polymerase 와 DNA 결합에 어떠한 영향을 미치는지 알아보았다. 특정위치에 손상을 입은 DNA를 순수하게 정제하고 방사성 동위원소로 표지한 후, 역시 순수하게 정제된 poly (ADP-ribose) polymerase 의 DNA 결합부위와 결합시키고 폴리아크릴아마이드 젤 전기영동법으로 결합 활성의 정도를 확인하였다. cis-syn 티민 이합체나 [6-4] 광부가물의 손상을 입은 DNA는 poly (ADP-ribose) polymerase 결합 활성이 크게 감소하였으나 메틸화된 구아닌 염기를 가져 변형된 염기쌍을 이루는 DNA는 결합 활성이 감소 하지 않았다. 손상을 입지 않은 DNA를 가지고 실험한 결과 poly (ADP-ribose) polymerase 의 효소활성은 DNA의 결합력과 양의 상관관계가 있음이 판명되었다. 이러한 결과들은 DNA가 B 형태 나선구조를 유지하는것이 poly (ADP-ribose) polymerase의 활성에 유리하다는 점을 보여주고 나아가 poly (ADP-ribose) polymerase가 DNA의 수선과정 중 마지막 단계인 중합효소ㆍ연결효소 단계에 관여한다는 점을 의미한다.
