Formation of the 3'-end is an essential step in almost all eukaryotic messenger RNA syntheses. The genomic DNA clone for poly(A)-binding protein II, which plays a crucial role in poly(A) addition and its length control, was isolated from mouse genomic library using cDNA probe. In order to elucidate the genomic structure of this clone, named mPAB II (murine poly(A)-binding protein II), the total sequence of 8.2 kb was determined. Its sequence shows that the genome of mPAB II consists of 7 exons and 6 introns, and indicates strong homology with that of the bovine PAB II. The predicted amino acid sequence contains one putative RNA-binding domain of the RNP type. Based on the examination of sequence elements at promoter region and CpG islands profile, it is estimated that this housekeeping gene might have a TATA$^{-}$Inr$^{+}$ promoter.
생쥐의 poly(A) 결합 단백질 II 유전자를 분리해내어 mPAB II라 명명하였다. 이 단백질은 거의 모든 진핵생물의 mRNA 합성과정에서 필수적인 단계인 3' 말단 형성에 참여, poly(A) 증가와 그것의 길이 조절을 담당하고 있다. 본 실험에서 클로닝된 유전자의 ORF 부분을 포함한 총 ~8.2kb의 염기 서열을 결정한 결과, mPAB II 유전자는 단백질을 암호화하고 있는 지역내에 6개의 intron들을 가지고 있음이 밝혀졌다. 또한 이 유전자의 염기 서열은 이미 알려진 소의 poly(A) 결합 단백질 II의 그것과 높은 상동성을 나타내었으며, 예상되는 아미노산 서열내에 하나의 RNP 타입 RNA 결합 모티프가 존재하였다. 이 유전자의 프로모터 부위를 규명하기 위한 염기 서열 분석과 실험으로부터, TATA box가 존재하지 않거나, 또는 있더라도 기능을 하지 않는 TATA-less 프로모터일 가능성이 제기되었으며, CpG 디누클레오티드의 분포를 조사해 본 결과 첫 번째 exon 주위에 CpG island가 존재하고 있음을 강하게 시사하였다. 따라서 이 지역이 Initiator (Inr)가 들어있는 TATA$^{-}$InR$^{+}$ 프로모터일 것으로 예상된다.
